Biopython 勉強開始

自分が興味のある分野としてBioinformaticsがあり、

Pythonで特にBiopythonというpackageがあるのでこれを学んでいこうと思う。

本家は以下URLから

Biopython - Biopython

最初なので、このBiopythonが何かをメモ。

・ Bioinformaticsで使われている様々なデータ構造のファイルをparse (構文解析) 可能

Blast output, ClustalW, FASTA, Genbank, Pubmed and Medline, ExPASy files, like Enzyme and Prosite

SCOP, including ‘dom’ and ‘lin’ files, UniGene, SwissProt

・Bioinformaticsで行われる解析について、このBiopythonであらゆることが実行可能

(詳しいことはそれぞれの章で詳しく見る予定)

ざっくり簡単に。使用されているデータ構造やツールの種類は多いので

それぞれに対応したモジュールを扱っている項目で詳しく学んでいく。

何ができるのか、今行っている作業がはかどるのか (毎回毎回似たようなコード書くのはウンザリ)

さて、中身が薄っぺらい記事になったがこれを第1回目として。